(1).过分注重短期效益

我国大多数物流企业都过分注重短期业绩，这使得企业管理者过分追求短期绩效，企业减少新产品的开发、工艺流程的改进、人力资源的开发、信息、技术和数据系统等各方面的开支,在短期内,这些削减可以使财务结果最大化。这就使得关注企业战略、重视长期价值创造的平衡计分卡在物流企业应用中受到阻碍。

(2)实施的成本较高

平衡计分卡要求物流企业从财务、客户、内部运营、学习成长四个层面考虑战略目标的实施,并为每个方面制定详细而明确指标,企业要付出较高的成本。

(3)反映不全面

未能反映一些必要的指标,比如它未能反映供应商、政府对物流企业影响的评价指标,这导致物流企业在应用平衡计分卡进行绩效评价的时候可能会对外部利益相关者关注不足,从而为企业经营发展带来一定不必要的麻烦。

(4)管理水平及理念相对落后

我国的物流企业大部分通过使用较低的人力成本来获得优势,而缺乏严格、规范、科学的企业管理实践,即使有些企业接受西方管理理论的成果,也难以做到与我国国情的有机结合,这些都导致平衡计分卡我国物流企业中应用面临着一定的困难。