1990年两德统一后,原西德联邦铁路(DB)和原东德国营铁路(DR)的管理机构也于1992年6月1日合并。属国家管理的部分成立联邦铁路资产管理局(BEⅤ)和联邦铁路局(EBA),属企业管理的部分建立筲国铁路股份公司(DBAG),基础设施管理和运营部门成为德国铁路股份公司下面的各事业部。1991年1月1日,德国铁路公司货运业务部正式成为在德国铁路控股公司(DBAG)下自主经营的铁路货运公司(DB Cargo AG)。德国铁路货运公司总部设在美因茨,负责领导分布在各地的管理地区运输生产的营业所。一个营业所管理若干个在当地经营业务的货运站。德国铁路货运公司利用先进的电子商务技术,创建了杜伊斯堡客户服务中心,为客户提供全程服务。
德国铁路货运公司逐步在货车上安装了GPS全球定位系统?随时掌握货车的定位信息,传送货车装载、技术状态的诊断数据,以及液态或气态货物的温度和压力信息,货车的定位精度达到100米。实行电子运单,取消传真打印的运单(危险货物、军事运输保留)。在跨境运输方面,已实现与周边国家交换货物列车信息,不再需要在边境站根据运单人工输入数据。
2001年4月其组织结桁进行了调整,主要特点是:客户服务中心由财务部划归生产部,以增强客户服务中心与生产计划部门的联系与配合。广州到芜湖物流公司将原来的市场部划分为装车运输和联合运输两个部门,以适应多式联运市场发展的需要。2001年6月又对组织结构进行了调整,撤销了企业发展部,将其发展战略、合作伙伴管理部门划归董事会主席直辖,物流服务部门划归装车运输部,以便更好地为该部门各市场单元提供物流运输方面的支持。同时,装车运输、联合运输部门中具体划分的市场单元都是一个独立的成本(利润)中心,对其收支盈亏情况都有考核。