计划职能提供了物流活动的目标及其实现的途径，组织和领导职能促进计划的顺利进行。理想中的计划制订和实施不需要进行控制，但在现实中由于环境的不断变化这几乎是不可能的，因此，物流管理者必须建立控制机制来确保所期望目标的实现。所谓的控制职能就是衡量实际履行的情况与计划的差异，纠正偏差的过程。此外，审时是为控制过程提供必要的信息，从而为有效控制提供决策依据，它同样属于控制的范畴。

        控制职能的发展依赖于有效的控制系统，控制系统包括需要控制的流程、参照标准、衡量偏差。需要控制的流程是控制系统的核心，这个流程可能是某一项单一活动，如履行订单、补充库存，也可能包括物流部门涉及的所有活动。作为需要控制流程的输入信息（通常以计划的形式输入流程，同时计划指明了流程设计的方法），还有流程末端的输出，即实际物流活动的绩效，它们共同构成了控制的内容。那些输入信息中没能考虑，可能影响流程输出的所有不确定性因素（如客户、竞争对手、供货商和政府的不确定性行为），也会制约控制系统作用的发挥。参照标准是控制系统的基本构成要素，具体标准包括期望利润、成本预算以及客户服务目标水平（按时交货率、破损率、配送准确率、库存准确率）等。衡量偏差则是控制系统的关键环节，通过对计划实际执行的情况和参照标准对比分析，“当绩效偏差是控制系统的关键环节，通过对计划执行情况和参照标准分析，提出改正措施。实践中的控制系统，还需要对一些细节问题加以明确，“当绩效的偏差达到多大时，需要采取措施”、“如果偏差超出控制系统的范畴，需要采取什么样的修正措施。

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